自2008年1月1日起，我國新《企業(yè)所得稅法》施行。同年，與之配套的高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理工作啟動(dòng)。據(jù)科技部統(tǒng)計(jì)，目前全國通過認(rèn)定的高新技術(shù)企業(yè)已近4萬個(gè)。2008年以來，這些通過認(rèn)定的高新技術(shù)企業(yè)陸續(xù)享受到企業(yè)所得稅優(yōu)惠稅率15%，而企業(yè)所得稅的稅率為25%.依照相關(guān)規(guī)定，高新技術(shù)企業(yè)只有通過認(rèn)定，才能享受到上述優(yōu)惠；高新技術(shù)企業(yè)資格自頒發(fā)證書之日起有效期為3年，到期復(fù)審。
2008年8月，由科技部、財(cái)政部、國家稅務(wù)總局組成的認(rèn)定小組啟動(dòng)高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定工作。根據(jù)《高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理辦法》，所有高新技術(shù)企業(yè)都需要依據(jù)新標(biāo)準(zhǔn)重新認(rèn)定。該辦法在核心自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)、研發(fā)活動(dòng)、研發(fā)費(fèi)用投入以及高新收入等方面均設(shè)置了嚴(yán)格條件，致全國高新企業(yè)重新洗牌。2009年底，全國高新技術(shù)企業(yè)共25386個(gè)，比實(shí)行新標(biāo)準(zhǔn)前的2007年底減少30661個(gè)，降幅高達(dá)54.7%.
依規(guī)定，高新資格自頒發(fā)證書之日起有效期為3年，2008年通過認(rèn)定的首批高新技術(shù)企業(yè)資格認(rèn)定到期。據(jù)悉，2008年，全國34個(gè)地區(qū)（不含新疆、西藏）共有15547家企業(yè)通過了高新技術(shù)企業(yè)評(píng)審認(rèn)定，記者從科技部了解到，目前，復(fù)審報(bào)備工作已經(jīng)結(jié)束，全國已有12849個(gè)于2008年取得高新資格的高新企業(yè)通過復(fù)審（截至2011年12月初）。
在高新企業(yè)認(rèn)定及所得稅優(yōu)惠實(shí)施過程中，由科技部、財(cái)政部、國家稅務(wù)總局等相關(guān)部門組成的認(rèn)定機(jī)構(gòu)對高新技術(shù)企業(yè)的監(jiān)管力度日益加大。3年來，審計(jì)署、財(cái)政部和科技部均對已通過認(rèn)定的高新技術(shù)企業(yè)進(jìn)行了抽查，部分已取得高新技術(shù)企業(yè)資質(zhì)的企業(yè)也因此被撤銷資格。對此，科技部等國家高新認(rèn)定主管部門明確提出，將通過高新技術(shù)企業(yè)復(fù)審集中清理掉不符合標(biāo)準(zhǔn)的高新企業(yè)。
企業(yè)所得稅優(yōu)惠對于扶持高新技術(shù)企業(yè)發(fā)展，提高我國企業(yè)自主創(chuàng)新能力起到了重大作用。實(shí)行高新技術(shù)企業(yè)新的認(rèn)定標(biāo)準(zhǔn)以來，盡管高新技術(shù)企業(yè)數(shù)量與2007年相比有所減少，但企業(yè)創(chuàng)造的凈利潤實(shí)現(xiàn)連年增加。2010年，全國高新技術(shù)企業(yè)凈利潤達(dá)9807億元，同比增長54.9%.同年，我國共投入研究開發(fā)經(jīng)費(fèi)7062.6億元，占國內(nèi)生產(chǎn)總值的1.76%。
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