例如，某企業(yè)籌建期開(kāi)辦費(fèi)為1000萬(wàn)元，籌建期歷時(shí)3年，2011年開(kāi)始生產(chǎn)經(jīng)營(yíng)取得收入，如果2009年~2010年的開(kāi)辦費(fèi)都作為當(dāng)年的虧損處理，意味著虧損彌補(bǔ)期少了3年。而按國(guó)稅函[2009]98號(hào)規(guī)定，2011年作為開(kāi)辦費(fèi)扣除，有效延長(zhǎng)了虧損彌補(bǔ)期限。如果2011年仍沒(méi)有足夠所得彌補(bǔ)虧損，可選擇作其他長(zhǎng)期待攤費(fèi)用，遞延3年扣除。
核定征收改為查賬征收方式如何彌補(bǔ)虧損
納稅人由查賬征收方式改為核定征收方式，再改為查賬征收方式的，其以前年度已確認(rèn)未彌補(bǔ)的虧損可從再改為查賬征收方式的年度起彌補(bǔ)，但彌補(bǔ)虧損期限以發(fā)生虧損年度的下一年開(kāi)始計(jì)算，5年內(nèi)不論盈虧或者改變征收方式，均連續(xù)計(jì)算彌補(bǔ)年限。
例如，某企業(yè)2009年為查賬征收所得稅企業(yè)，累計(jì)未彌補(bǔ)虧損150萬(wàn)元，其中：2007年虧損20萬(wàn)元，2008年虧損30萬(wàn)元，2009年虧損100萬(wàn)元。2010年采取核定征收，前期虧損不允許在2010年度稅前彌補(bǔ)。其2011年又轉(zhuǎn)為查賬征收，實(shí)現(xiàn)利潤(rùn)50萬(wàn)元，2011年可彌補(bǔ)以前年度虧損50萬(wàn)元。假設(shè)2012年實(shí)現(xiàn)利潤(rùn)50萬(wàn)元，仍可彌補(bǔ)以前年度虧損50萬(wàn)元。
減征免征所得項(xiàng)目與應(yīng)稅項(xiàng)目的盈虧互抵處理
《國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于做好2009年度企業(yè)所得稅匯算清繳工作的通知》（國(guó)稅函[2010]148號(hào)）明確，對(duì)企業(yè)取得的免稅收入、減計(jì)收入以及減征、免征所得額項(xiàng)目，不得彌補(bǔ)當(dāng)期及以前年度應(yīng)稅項(xiàng)目虧損；當(dāng)期形成虧損的減征、免征所得額項(xiàng)目，也不得彌補(bǔ)當(dāng)期和以后納稅年度應(yīng)稅項(xiàng)目所得抵補(bǔ)。
例如，某企業(yè)2011年應(yīng)稅項(xiàng)目所得100萬(wàn)元，當(dāng)年取得符合免稅條件的居民企業(yè)之間的股息、紅利等權(quán)益性投資收益50萬(wàn)元，發(fā)生符合條件的技術(shù)轉(zhuǎn)讓損失為300萬(wàn)元。該公司2011年發(fā)生的技術(shù)轉(zhuǎn)讓損失300萬(wàn)元，不能用投資收益50萬(wàn)元進(jìn)行彌補(bǔ)，只能用以后年度減征、免征所得額來(lái)彌補(bǔ)；也不能用應(yīng)稅項(xiàng)目所得100萬(wàn)元來(lái)彌補(bǔ)，2011年應(yīng)納企業(yè)所得稅＝100×25%＝25（萬(wàn)元）。另外，除另有規(guī)定（企業(yè)合并、分立適用特殊性稅務(wù)處理時(shí)虧損的繼承彌補(bǔ)）外，境內(nèi)企業(yè)之間、境內(nèi)與境外企業(yè)之間、境外企業(yè)之間的盈虧不得互抵。但同一國(guó)家分支機(jī)構(gòu)之間的盈虧允許互抵。企業(yè)在匯總繳納企業(yè)所得稅時(shí)，境內(nèi)分支機(jī)構(gòu)之間的盈虧允許互抵，境外同一國(guó)家（地區(qū)）分支機(jī)構(gòu)之間的盈虧允許互抵，境外不同國(guó)家（地區(qū)）分支機(jī)構(gòu)之間的盈虧也不得互抵。
資產(chǎn)損失追補(bǔ)確認(rèn)出現(xiàn)虧損的彌補(bǔ)
《國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于發(fā)布〈企業(yè)資產(chǎn)損失所得稅稅前扣除管理辦法〉的公告》（國(guó)家稅務(wù)總局公告2011年第25號(hào)）規(guī)定，企業(yè)因以前年度實(shí)際資產(chǎn)損失未在稅前扣除而多繳的企業(yè)所得稅稅款，可在追補(bǔ)確認(rèn)年度企業(yè)所得稅應(yīng)納稅款中予以抵扣，不足抵扣的，向以后年度遞延抵扣。企業(yè)實(shí)際資產(chǎn)損失發(fā)生年度扣除追補(bǔ)確認(rèn)的損失后出現(xiàn)虧損的，應(yīng)先調(diào)整資產(chǎn)損失發(fā)生年度的虧損額，再按彌補(bǔ)虧損的原則，計(jì)算以后年度多繳的企業(yè)所得稅稅款，并按前款辦法進(jìn)行稅務(wù)處理。
例如，某企業(yè)2010年度發(fā)生資產(chǎn)損失100萬(wàn)元，當(dāng)年未能扣除。2010、2011年度匯算清繳納稅調(diào)整后所得分別為80、60萬(wàn)元，2010年應(yīng)納稅額＝80×25%＝20（萬(wàn)元），2011年應(yīng)納稅額＝60×25%＝15（萬(wàn)元）。2012年3月，企業(yè)向稅務(wù)機(jī)關(guān)申請(qǐng)追補(bǔ)扣除該資產(chǎn)損失。為此，2010年度納稅調(diào)整后所得＝80－100＝－20（萬(wàn)元），無(wú)須納稅；2011年度應(yīng)納稅額＝（60－20）×25%＝10（萬(wàn)元）。則該企業(yè)2010、2011年分別多繳企業(yè)所得稅20萬(wàn)元、5萬(wàn)元。
查增應(yīng)納稅所得額彌補(bǔ)以前年度虧損如何處理
《國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于查增應(yīng)納稅所得額彌補(bǔ)以前年度虧損處理問(wèn)題的公告》（國(guó)家稅務(wù)總局公告2010年第20號(hào)）規(guī)定，稅務(wù)機(jī)關(guān)對(duì)企業(yè)以前年度納稅情況進(jìn)行檢查時(shí)調(diào)增的應(yīng)納稅所得額，凡企業(yè)以前年度發(fā)生虧損、且該虧損屬于企業(yè)所得稅法規(guī)定允許彌補(bǔ)的，應(yīng)允許調(diào)增的應(yīng)納稅所得額彌補(bǔ)該虧損。彌補(bǔ)該虧損后仍有余額的，按照企業(yè)所得稅法規(guī)定計(jì)算繳納企業(yè)所得稅。
例如，某企業(yè)經(jīng)稅務(wù)機(jī)關(guān)檢查后需調(diào)增2011年應(yīng)納稅所得額100萬(wàn)元，該企業(yè)2010年及以前年度存在虧損。假設(shè)企業(yè)2009年度自行申報(bào)虧損100萬(wàn)，2009年應(yīng)納稅所得額50萬(wàn)，彌補(bǔ)以前年度虧損50萬(wàn)，累計(jì)結(jié)轉(zhuǎn)可在以后年度彌補(bǔ)的虧損額50萬(wàn)元。2012年經(jīng)稅務(wù)稽查應(yīng)調(diào)增2011年度應(yīng)納稅所得100萬(wàn)。調(diào)增的所得額100萬(wàn)元可用于彌補(bǔ)以前年度虧損50萬(wàn)元，盈余的50萬(wàn)應(yīng)按適用稅率補(bǔ)繳企業(yè)所得稅。
被投資企業(yè)的虧損不能在投資方扣除
《國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于企業(yè)所得稅若干問(wèn)題的公告》（國(guó)家稅務(wù)總局公告2011年第34號(hào)）第五條第二款規(guī)定，被投資企業(yè)發(fā)生的經(jīng)營(yíng)虧損，由被投資企業(yè)按規(guī)定結(jié)轉(zhuǎn)彌補(bǔ)；投資企業(yè)不得調(diào)整減低其投資成本，也不得將其確認(rèn)為投資損失。
例如，某公司投資另一企業(yè)，持有其30%股權(quán)，該公司采取權(quán)益法做賬，2011年虧損1500萬(wàn)元，該公司在會(huì)計(jì)上調(diào)減了450萬(wàn)元會(huì)計(jì)利潤(rùn)。權(quán)益法確認(rèn)的投資收益在稅法上不做收入處理，對(duì)應(yīng)的被投資企業(yè)的虧損也不允許在企業(yè)所得稅前扣除。因此，該企業(yè)450萬(wàn)元應(yīng)做納稅調(diào)增處理。
清算所得如何彌補(bǔ)企業(yè)以前年度虧損
《財(cái)政部、國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于企業(yè)清算業(yè)務(wù)企業(yè)所得稅處理若干問(wèn)題的通知》（財(cái)稅[2009]60號(hào)）規(guī)定，企業(yè)清算中應(yīng)依法彌補(bǔ)虧損，確定清算所得，企業(yè)應(yīng)將整個(gè)清算期作為一個(gè)獨(dú)立的納稅年度計(jì)算清算所得。例如，某企業(yè)2011年7月停止生產(chǎn)經(jīng)營(yíng)，并辦理注銷(xiāo)登記。注銷(xiāo)前企業(yè)按規(guī)定辦理了2011年度企業(yè)所得稅匯繳，申報(bào)2011年度納稅調(diào)整后所得為－300萬(wàn)元。2006年~2010年度納稅調(diào)整后所得分別為－250萬(wàn)元、－100萬(wàn)元、30萬(wàn)元、50萬(wàn)元、80萬(wàn)元。在注銷(xiāo)前，企業(yè)按規(guī)定辦理清算所得企業(yè)所得稅計(jì)算申報(bào)，清算所得為1000萬(wàn)元。由于清算期間作為一個(gè)納稅年度，2006年度虧損只能在2011年度彌補(bǔ)，尚未彌補(bǔ)的虧損90萬(wàn)元（250－30－50－80）不能結(jié)轉(zhuǎn)到清算期間彌補(bǔ)。
